Dans Nanostray sur DS prenez les commandes d'un vaisseau dans un shoot'em up futuriste. Améliorez la puissance de feu de vos vaisseaux au fil des 18 niveaux et modifiez leurs fonctionnalités en temps réel via l'écran de la DS. En plus du mode solo, grâce aux fonctionnalités wi-fi de la console vous pouvez jouer en coopératif à 2 joueurs.